.HMM fájlkiterjesztés
HMMER adatok
A .hmm kiterjesztésű fájlok a HMMER által használt rejtett Markov-modelladatokat tartalmazzák.
A HMMER egy bioinformatikai szoftvercsomag homológ fehérjeszekvenciák keresésére szekvencia-adatbázisokban és fehérjeszekvencia-kapcsolatok elemzésére.
A HMMER egy parancssori bioinformatikai programcsomag, amely homológ fehérjeszekvenciák szekvencia-adatbázisainak keresésére, valamint fehérjeszekvencia-illesztések létrehozására vagy használatára szolgál. Egy .hmm fájl általában egy vagy több, szekvencia-illesztésekből összeállított rejtett Markov-modellt tartalmaz.
A fájl egy szöveges adatfájl, amely modellparamétereket tartalmaz, beleértve a szekvenciacsalád megőrzött és változó pozícióinak megjelenítésére használt valószínűségeket. A HMMER programok ezeket a modelleket bemenetként használják a szekvenciakeresésekhez és a kapcsolódó elemzésekhez; ezek általában nem önálló dokumentumok.
A HMMER-t elsősorban Linuxon és más Unix-szerű rendszereken használják. A .hmm formátum elavultnak tekinthető, és a régebbi fájlok átalakítást vagy kompatibilis HMMER kiadást igényelhetnek, mielőtt megbízhatóan használhatók.
A HMMER egy bioinformatikai szoftvercsomag homológ fehérjeszekvenciák keresésére szekvencia-adatbázisokban és fehérjeszekvencia-kapcsolatok elemzésére.
A HMMER egy parancssori bioinformatikai programcsomag, amely homológ fehérjeszekvenciák szekvencia-adatbázisainak keresésére, valamint fehérjeszekvencia-illesztések létrehozására vagy használatára szolgál. Egy .hmm fájl általában egy vagy több, szekvencia-illesztésekből összeállított rejtett Markov-modellt tartalmaz.
A fájl egy szöveges adatfájl, amely modellparamétereket tartalmaz, beleértve a szekvenciacsalád megőrzött és változó pozícióinak megjelenítésére használt valószínűségeket. A HMMER programok ezeket a modelleket bemenetként használják a szekvenciakeresésekhez és a kapcsolódó elemzésekhez; ezek általában nem önálló dokumentumok.
A HMMER-t elsősorban Linuxon és más Unix-szerű rendszereken használják. A .hmm formátum elavultnak tekinthető, és a régebbi fájlok átalakítást vagy kompatibilis HMMER kiadást igényelhetnek, mielőtt megbízhatóan használhatók.
Fájl információ
- Kiterjesztés:
- .HMM
- Típus kód:
- HMM
- Kategória:
- Adat